塩基数から分子量への換算
- デオキシヌクレオチドの平均分子量:330 Da
- DNA塩基対の平均分子量:660 Da
つまり、
二本鎖DNAの分子量 = [塩基対の数] × [660 Da]
一本鎖DNAの分子量 = [塩基の数] × [330 Da]
となります。
5’末端(もしくは3’末端)のpmolの計算
- 二本鎖DNA分子の末端のpmol =(2 × 106 × µg)/([塩基対の数] × 660)
- 一本鎖DNA分子の末端のpmol =(1 × 106 × µg)/([塩基の数] × 330)
- 制限酵素切断により生じる各末端のpmol(環状DNA):2 ×(pmol DNA)×(切断サイト数)
- 制限酵素切断により生じる各末端のpmol(直鎖状DNA):2 ×(pmol DNA)×(切断サイト数)+ [2 ×(pmol DNA)]
µgからpmolへの換算
- pmol(二本鎖DNA)= µg(二本鎖DNA)× 104 /([塩基対の数] × 6.6)
- pmol(一本鎖DNA)= µg(一本鎖DNA)× 104 /([塩基の数] × 3.3)
pmolからµgへの換算
- µg(二本鎖DNA)= pmol(二本鎖DNA)× [塩基対の数] × 6.6 × 10-4
- µg(一本鎖DNA)= pmol(一本鎖DNA)× [塩基の数] × 3.3 × 10-4